豐臣秀吉遺命從朝鮮撤軍。五大老決定密不發(fā)喪，以豐臣秀吉名義指示在朝各軍撤退回國，爭取最體面的議和。日軍的撤退部署是：東部駐西生浦、梁山、竹島各部，于十一月先行撤退，在釜山集結(jié)，候船返國；中部居昌的日軍，就地上船返回本國；西部駐順天、泗川、南海、固城之日軍，待東部日軍撤離后，分頭到巨濟(jì)島集結(jié)，再乘船返國。并且約定十一月十五日為最后撤退期限。
從九月起，中朝兩國海軍不斷在海上截?fù)舫吠嘶貒娜哲娕炾?duì)，使日軍遭受巨大損失。十一月十五日的最后撤退期限已至，但小西行長被李舜臣截住，難以回國。十八日，島津義弘率艦隊(duì)乘夜來接小西行長。十九日，中朝海軍與日軍進(jìn)行了一場侵朝戰(zhàn)爭中最大規(guī)模的海戰(zhàn)——露粱海戰(zhàn)。此戰(zhàn)共擊沉焚毀日軍艦只四百余艘，日軍傷亡數(shù)萬人。但不幸的是，李舜臣與明海軍將領(lǐng)鄧子龍雙雙戰(zhàn)死。
至此，日軍殘余已經(jīng)全部撤退回國，文祿、慶長之役結(jié)束。在這場戰(zhàn)爭中，日本各藩國人力物力的損失十分慘重。侵朝戰(zhàn)爭的失敗，也是促成豐臣政權(quán)垮臺的重要原因。
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